图片来自Genome Biology and Evolution, doi:10.1093/gbe/evw038
2016年3月23日,国际学术期刊Genome Biology and Evolution 发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所Philipp Khaitovich研究组的研究论文“Changes in snoRNA and snRNA abundance in the human, chimpanzee, macaque and mouse brain”。该研究首次绘制了哺乳动物大脑snRNA和snoRNA表达图谱,发现哺乳动物大脑snRNA和snoRNA表达水平存在广泛差异。
snRNA和snoRNA是功能和进化保守的转录调控元件,但长期以来缺乏其在人脑转录组水平的系统研究。Philipp Khaitovich研究组与俄罗斯莫斯科大学教授Mikhail S. Gelfand合作,利用高通量测序技术系统地测定了人、黑猩猩、恒河猴和小鼠大脑前额叶皮质组织中snRNA和snoRNA的表达量,通过比较分析发现snRNA和snoRNA在基因家族水平上非常保守,但是其中U1和SNORA29表达量在人脑中却发生了巨大变化。SNORA29 在人脑中表现为特异表达缺失,并且实验发现SNORA29在非人灵长类的神经元中特异表达,提示其在人脑认知功能形成中的潜在作用。同时,该研究发现与mRNA的表达主要受启动子调控不同,二级结构稳定性是snoRNA表达调控的重要机制。
在一项新的研究中,来自英国爱丁堡大学的研究人员揭示出上千个基因突变如何影响细胞的存活机会。相关研究结果于2016年4月14日在线发表在Science期刊上,论文标题为“Network of epistatic interactions within a yeast snoRNA”。该研究得到英国医学研究委员会(MRC)和惠康基金会的资金资助。
在一项新的研究中,我国中山大学医学院生物教研室的姚成果团队与美国加州大学欧文分校的Yongsheng Shi教授团队通过生化分析和大规模测序,发现mRNA 3'末端加工复合体和部分snoRNA相互作用。相关研究结果于2017年7月26日在线发表在Nucleic Acids Research期刊上,论文标题为“A snoRNA modulates mRNA 3’ end processing and regulates the expression of a subset of mRNAs”。
2016年11月10日,《基因与发育》(Genes & Development)杂志在线发表了中国科学院生物物理研究所许瑞明研究组关于剪接复合体核心组分snRNP组装机制的研究进展,文章题为Structural basis for snRNA recognition by the double-WD40 repeat domain of Gemin5。
5月4日,上海生化所的陈玲玲研究员在cell上发表题为《SLERT Regulates DDX21 Rings Associated with Pol I Transcription》的文章,该研究揭示了长非编码RNA SLERT通过松弛DDX21的环形结构,从而促进Pol I转录 rRNA的重要作用。