在一项新的研究中,来自英国、丹麦、肯尼亚、南非、澳大利亚、瑞典和法国的研究人员构建出疟疾细胞图谱(Malaria Cell Atlas),这种图谱呈现出疟原虫在所有形态生命周期阶段的转录组学特征。这种图谱的目标是(i)了解在整个生命周期中的基因功能和使用;(ii)理解发育阶段转变背后的基因调控机制;(iii)发现疟原虫两头下注(bet-hedging)模式;(iv)提供一种参考数据集,可用于了解多种疟原虫物种在实验室中和在自然感染下的寄生虫生物学特性。相关研究结果发表在2019年8月23日的Science期刊上,论文标题为“The Malaria Cell Atlas: Single parasite transcriptomes across the complete Plasmodium life cycle”。
细胞依赖于称为ATP合酶(ATP synthase)或ATP酶(ATPase)的蛋白复合物来满足它们的能量需求。三磷酸腺苷(ATP)分子为维持生命的大部分过程提供能量。在一项新的研究中,奥地利科学技术研究所的结构生物学者Leonid Sazanov和博士后研究员Long Zhou如今解析出V/A-ATP酶家族代表性成员的首个原子结构,填补了这些必不可少的分子机器的进化树上的空白。利用最新的低温电镜(cryo-EM)方法获得的这些结果揭示了这种酶的结构类似于涡轮机或水磨机。相关研究结果发表在2019年8月23日的Science期刊上,论文标题为“Structure and conformational plasticity of the intact Thermus thermophilus V/A-type ATPase”。
对人类和植物中细胞的自我破坏的研究可能导致人们开发出治疗神经退行性脑疾病的方法和培育出抗病植物。在一项新的研究中,来自澳大利亚、美国和英国的研究人员确定了某些蛋白在细胞自杀中的作用。相关研究结果发表在2019年8月23日的Science期刊上,论文标题为“NAD+ cleavage activity by animal and plant TIR domains in cell death pathways”。论文通讯作者为澳大利亚昆士兰大学的Bostjan Kobe、Thomas Ve和Peter Dodds。
在针对整个非洲大陆的首个疟原虫基因组研究中,来自赞比亚、加纳、肯尼亚、美国、英国、埃塞俄比亚、马达加斯加、坦桑尼亚、喀麦隆、德国、科特迪瓦、加蓬、尼日利亚和马里的研究人员发现了栖息在这个大陆不同地区的恶性疟原虫的遗传特征,包括赋予抗疟疾药物耐药性的遗传因子。这揭示了耐药性在不同地区出现以及通过非洲各种途径行进传播的方式,这使得之前的疟疾成功控制面临风险。相关研究结果发表在2019年8月23日的Science期刊上,论文标题为“Major subpopulations of Plasmodium falciparum in sub-Saharan Africa”。
绘制基因相互作用通常基于作为表型读出值的细胞适应性,这模糊了这些相互作用在机制上的起源。Norman等人制定了绘制和理解基因相互作用的框架。这种方法利用CRISPR介导的汇集扰动筛选(CRISPR-mediated, pooled perturbation screens)中收集的高维单细胞RNA测序数据。不同的转录组表型构成了代表细胞所有可能状态的“流形(manifold)”。每个扰动和基因相互作用将细胞状态投射到这个流形中的特定位置,从而实现对信号通道中的基因的无偏序排列和对基因相互作用的系统分类。