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Cell:组学全景分析推动前列腺癌精准治疗 基因转录蛋白数据

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发表于 2016-11-8 19:39:23 | 显示全部楼层 |阅读模式
Cell:组学“全景”分析推动前列腺癌精准治疗

基因组和转录组学数据,磷酸化蛋白质组学数据

译文来源:生物谷 2016-08-15 14:23

2016年8月15日讯 /生物谷BIOON/ --最近来自美国UCLA的癌症研究人员开发了一组复杂的分析工具对患有转移性前列腺癌的病例进行分析,绘制了帮助前列腺癌细胞增殖和抵抗治疗的复杂基因和蛋白质网络的详细图谱。研究人员还开发了一种计算方法来分析病人个体化数据帮助每位病人选择最有效的治疗药物。

相关研究结果发表在国际学术期刊Cell上。

研究人员首先对活检获得的转移性前列腺癌病人的组织样本进行了一系列复杂分析,并且对每个病人癌细胞的描述达到了前所未有的详细程度。随后研究人员又利用一种新的计算分析方法对获得的数据集进行分析,获得了对应每个病人癌细胞的个体化信号通路图表,该研究成果为转移性前列腺癌治疗提示了潜在的治疗靶标。

癌症基因组学通过揭示驱动每个病人肿瘤细胞的基因突变为癌症精准治疗提供了希望,癌细胞基因突变会通过影响参与细胞生长增殖及其他生理过程的信号途径发挥促癌作用。找到前列腺癌细胞中活跃的关键途径,就有望在这些途径中找到“主要分子开关”从而开发靶向治疗药物。

在美国UCLA的研究人员领导的这项工作中,他们在前列腺癌细胞和组织中对癌细胞的蛋白质磷酸化进行了全面解读。研究人员利用计算分析整合了磷酸化蛋白质组学数据和基因组以及基因表达数据,提供了一个关于晚期前列腺癌的激活型信号途径的全景图谱。

研究人员表示:“除了获得传统的基因组和转录组学数据,磷酸化蛋白质组学数据会进一步帮助我们对这种疾病的异常信号进行深入了解。我们开发的这种方法将这些大型数据库整合在一起可以帮助我们了解驱动每个病人疾病发生的原因。”

这项新研究还揭示了抗雄激素治疗抵抗背后的一些机制。据研究人员介绍在许多病例中单个突变会导致雄激素受体蛋白发生改变。在其他病例中,即使雄激素受体已经被阻断仍会有替代激酶信号途径让癌细胞继续保持生长。

对每个病人进行分析可以为临床治疗提供相关信息,帮助病人选择最为有效的治疗药物。(生物谷Bioon.com)

DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2016.07.007

Phosphoproteome Integration Reveals Patient-Specific Networks in Prostate Cancer

Justin M. Drake19, Evan O. Paull19, Nicholas A. Graham, John K. Lee, Bryan A. Smith, Bjoern Titz, Tanya Stoyanova, Claire M. Faltermeier, Vladislav Uzunangelov, Daniel E. Carlin, Daniel Teo Fleming, Christopher K. Wong, Yulia Newton, Sud Sudha, Ajay A. Vashisht, Jiaoti Huang, James A. Wohlschlegel, Thomas G. Graeber, Owen N. Witte, Joshua M. Stuart

http://www.cell.com/cell/abstrac ... 38%3Fshowall%3Dtrue



http://news.bioon.com/article/6688345.html
20160815102715679.jpg
 楼主| 发表于 2016-11-8 19:50:47 | 显示全部楼层

Science:单一基因或可驱动前列腺分化 内衬胞转

Science:单一基因或可驱动前列腺分化

2016-06-28 17:20

2016年6月28日讯/生物谷BIOON/--最近,一项发表在国际杂志Science上的研究论文中,来自哥伦比亚大学医学中心的研究人员通过研究发现,单一基因的表达就可以将骨盆精囊中的内衬细胞转化成为前列腺细胞,这项研究或可帮助深入理解控制前列腺组织和精囊发育背后的分子机制,同时还可以帮助科学家们揭示为何癌症通常多发于前列腺而很少在精囊组织中发生。

此前研究中,研究者Aditya·Dutta等人通过研究发现,Nkx3.1基因的缺失会损伤小鼠前列腺的分化;为了深入研究Nkx3.1基因,首先研究人员证实,前列腺细胞中Nkx3.1基因的缺失会导致和前列腺分化的一系列基因表达水平的降低。

随后研究者利用表达Nkx3.1基因的病毒感染精囊上皮细胞,结果发现,诱导该基因表达会促进精囊上皮细胞转化成为前列腺样状态的细胞,而这种转化后的细胞在结构、遗传标记及组织学表现上均同前列腺细胞类似。

研究者认为,对人类前列腺细胞进行深入研究,或许会帮助鉴别出参与组织再组装更新过程中所涉及的多种调节网络组分,其中就包括特殊的组蛋白修饰酶类;后期研究人员还将继续通过更为深入的研究来理解前列腺癌组织特异性的奥秘,或为开发治疗前列腺癌的新型疗法提供一定思路和希望。(生物谷Bioon.com)

Identification of an NKX3.1-G9a-UTY transcriptional regulatory network that controls prostate differentiation

http://science.sciencemag.org/content/352/6293/1576

http://news.bioon.com/article/6684753.html



Science:前列腺癌只需少许神经 抑交副交阻癌生播

Science:前列腺癌只需少许神经

译文文来源:EurekAlert!中文  2013-7-12 9:05:14

关键词: 前列腺

人们已知肿瘤会触发新血管的生长以促进对其氧气和营养物质的供应。但是,根据一项对小鼠的新的研究,这种所谓的肿瘤血管生成并非肿瘤利用其健康组织“微环境”来加速其生长的唯一方法:研究人员说,当某些类型的神经纤维在前列腺肿瘤附近或肿瘤内生长时,前列腺癌会变得更加致命和富有侵略性。ClaireMagnon及其同事研究了前列腺癌的小鼠模型并发现,在肿瘤中及肿瘤周围的高密度的神经生长可帮助前列腺癌的生长及扩散。研究人员观察到,手术性或化学性破坏前列腺内的交感神经——即那些与“战或逃”有关的神经——可防止肿瘤的早期生长,而用药理学的方法抑制副交感神经——即那些发出“休息与消化”信号的神经——则可抑制肿瘤的播散。研究人员还分析了来自43位前列腺癌患者的肿瘤样本并发现,在肿瘤内及肿瘤周围的高密度的这种神经纤维与不良的临床转归有关。鉴于其发现,Magnon及她的同事提出,抑制这些神经发育的药物作为一种可能的前列腺癌疗法而值得人们研究。一则由JohnIsaacs撰写的《观点栏目》文章更为详细地讨论了这些发现。

http://www.sciencemag.org/content/341/6142/1236361.short



Nat Cell Biol:科学家找到控制前列腺癌进展和转移的代谢总开关 转录共调节因子能抑制前列腺癌进展和转移 :

http://www.kaseisyoji.com/viewth ... amp;extra=#pid81814



Cell Rep:治疗前列腺癌新方法 地塞米松抑ER基 :

http://www.kaseisyoji.com/viewth ... 7%E8%85%BA%E7%99%8C



新加坡总理李显龙2015-2-16接受手术治疗前列腺癌  使用达芬奇手术机器人 :

http://www.kaseisyoji.com/viewth ... 7%E8%85%BA%E7%99%8C

 楼主| 发表于 2016-11-8 20:15:13 | 显示全部楼层
细胞:晚期前列腺癌与两基因突变密切相关 BRCA1  2

作者:Dan Robinson

来源:《细胞》

发布时间:2015/6/29 16:07:53

晚期前列腺癌与两基因突变密切相关

美国纪念斯隆—凯特琳癌症中心近日意外发现,与乳腺癌和卵巢癌相关的两个基因的突变,可能与晚期前列腺癌密切相关。这一发表在近期《细胞》期刊上的发现可带来新的治疗方法。

研究人员从150名前列腺癌晚期患者的肿瘤组织中提取DNA,分析后发现,约15%患者的BRCA1基因或BRCA2基因发生突变,另外5%患者的类似功能的基因产生畸变。此前的研究曾发现,在一小部分前列腺癌早期患者中,存在这种基因突变,但研究人员却没有料到在晚期患者中,该现象如此普遍。数据统计显示,每年约有22万美国人诊断出患有前列腺癌,其中一些患者最终发生肿瘤转移,死于前列腺癌的患者每年约3万人。

这一新发现将为20%采用常规激素治疗没有效果的患者带来福音。这些患者可以考虑采用聚腺苷二磷酸—核糖聚合酶(PARP)抑制剂,该药现已被批准用于BRCA基因突变的晚期卵巢癌患者的治疗,此前尚未有人考虑利用该药物治疗前列腺癌。此外,顺铂化疗也是一个选择。

利用基因测序来治疗癌症又被称为精确治疗。精确治疗目前正在改变许多癌症患者的命运,如发现肺癌中被称为EGFR(表皮生长因子受体)或ALK(间变性淋巴瘤激酶)致癌基因变异,医生就会使用某些针对这些基因变异的特定药物。

由于此前针对前列腺癌基因测序大都集中在早期,大多数患者直至发生肿瘤转移,才会采取类似的治疗手段,其结果差异非常大,限制了精确治疗的作用。大量的临床试验表明, 利用精确疗法可以成功地延长患者的生命,但对肿瘤活检进行基因测序分析却十分困难。肿瘤组织通常是来自前列腺本身,但由于患者通常在早期阶段就摘除了前列腺,因此需要从骨头、肝脏和淋巴结等处提取肿瘤进行活检,而医生和病人大多不情愿。

该研究表明,晚期前列腺癌患者应该进行分子分析,这样有助于改善其治疗方案。此外,该研究结果进一步证明, 有多种不同的癌症均存在基因异常现象,因此利用与某特定基因突变相匹配的药物进行治疗,可能比使用仅针对某种恶性肿瘤的药物更有疗效。

研究称,约89%的癌症患者有基因异常现象,而这些基因异变可能已有上市药品或正在测试的药物对其进行治疗。因此研究人员认为,该发现更是具有非凡的意义。( 何屹)

http://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(15)00548-6

http://paper.sciencenet.cn/htmlpaper/20156291675392636538.shtm



《自然—通讯》 :脂肪细胞分泌蛋白质或刺激前列腺癌恶化 趋化因子 :

http://www.kaseisyoji.com/viewth ... 7%E8%85%BA%E7%99%8C



Can c:前列腺癌为何骨转移?一关键信号途径在作祟 TGF促癌移 :

http://www.kaseisyoji.com/viewth ... 7%E8%85%BA%E7%99%8C



Sci Rep:乳癌、前列腺癌生物标志物家族再添新成员 刚性DI损 :

http://www.kaseisyoji.com/viewth ... 7%E8%85%BA%E7%99%8C



《自然》:美研究发现疑似前列腺癌干细胞 :

http://www.kaseisyoji.com/viewth ... 7%E8%85%BA%E7%99%8C



Can Preve Res:同时食用大豆和西红柿或更有效地抑制前列腺癌 :

http://www.kaseisyoji.com/viewth ... amp;extra=#pid77590



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