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《自然》:科学家测定向日葵基因组

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发表于 2017-5-25 18:31:20 | 显示全部楼层 |阅读模式
作者:Nicolas Langlade

来源:《自然》

发布时间:2017/5/25 13:18:32

科学家测定向日葵基因组

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《自然》近日发表的一篇论文报告了一个高质量的向日葵参考基因组。这一资源将为未来的研究提供借鉴,帮助人们在考虑到农业限制因素和人类营养需求的前提下,利用遗传多样性改善向日葵的抗逆性和产油量。

向日葵是一种全球性的油料作物。由于能在包括干旱在内的各种环境条件下保持稳定的产量,向日葵显示出了适应气候变化的特征。然而直到最近,研究者都难以完成向日葵基因组的组装,因为它主要是由高度相似的相关序列组成的。

法国卡斯塔内托洛桑国家农业研究院的Nicolas Langlade及同事测序了驯化向日葵的基因组,并进行了比较和全基因组分析,为一类开花植物——菊类植物的演化史带来了启示。他们还找到了新的候选基因,并重构了花期和油脂代谢这两大育种性状的遗传网络,并发现花期网络是由最近的全基因组倍增塑造的。

这意味着,在数千万年中,古老的横向同源基因(基因组中由于倍增产生的同源基因)都能在同一调控网络中保留下来。研究人员总结称,他们的研究强化了向日葵作为生物、演化和气候变化适应研究模型的地位,且有助于加快向日葵育种。(中文来源:科学网 张章)

http://paper.sciencenet.cn/htmlpaper/201752513183239743987.shtm

http://www.nature.com/nature/jou ... ll/nature22380.html



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 楼主| 发表于 2017-5-25 18:40:52 | 显示全部楼层
软件译:

自然| 信        开放

向日葵基因组提供了对油代谢,开花和Asterid进化的见解

HélèneBadouin,        JérômeGouzy,        克里斯托弗J. Grassa,        Florent Murat,        S.埃文·斯顿, Ludovic Cottret,        Christine Lelandais-Brière,        格雷戈里·欧文斯,        塞瓦斯蒂·卡雷,        Baptiste Mayjonade,        Ludovic Legrand,        Navdeep Gill,        诺兰C.凯恩,        约翰·E·鲍尔斯,        Sariel Hubner, Arnaud Bellec,        AurélieBérard,        HélèneBergès,        尼古拉斯Blanchet,        玛丽-克劳德·博尼,        多米尼克·布鲁内尔,        Olivier Catrice,        Nadia Chaidir,        Clotilde Claudel,        CécileDonnadieu et al。
隶属关系捐款通讯作者
性质 (2017) DOI:10.1038 / nature22380
收到 2016年11月29日 公认 2017年4月16日 在线发布 2017年5月22日

驯化的向日葵,向日葵,是一种全球性的油料作物,具有应对气候变化适应的前景,因为它可以在多种环境条件下保持稳定的产量,包括干旱1。更大的弹性是通过性等位基因从兼容的野生向日葵亲戚矿业实现2,3,包括许多嗜极物种4。在这里,我们报告了向日葵基因组(3.6 gigabases)的高品质参考,以及来自营养和花器官的广泛转录组学数据。基因组主要由高度相似的相关序列5组成,并且需要用于成功组装的单分子实时测序技术。基因组分析能够重建Asterids的进化史,进一步确立了Asterids II进化枝6基因全基因组三倍体的存在,以及约2900万年前的向日葵特异性全基因组重复7。结合定量遗传学,表达和多样性数据的综合方法,允许开发两个主要育种性状,开花时间和油代谢的综合基因网络,并在这些网络中揭示了新的候选基因。我们发现开花时间的基因组结构已经由最近的全基因组重复形成,这表明古代的旁系同源物可以保持在几十万年的同一个监管网络中。这个基因组代表了未来的研究计划,旨在利用遗传多样性,提高生物和非生物胁迫抗性和石油生产的基石,同时还要考虑农业的制约和人的营养需求8,9。

详细:
http://www.nature.com/nature/jou ... ll/nature22380.html



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